Tarihte İstinye Leosthenion, Lasthenes, Sosthenion, Sthenos ve Stenia isimleri ile anılmıştır. İstinye koyunun derin ve korunaklı yapısı her dönemde bölgeden geçen gemiler için korunma yeri olmasını sağlamıştır. 16yy’dan sonra gelişmeye başlayan İstinye’de 18yy’dan itibaren de sahil boyunca yerleşme ve yalılar başlamıştır.
İstinye’de günümüzdeki şekli ile sanayinin başlangıcı olarak 1912 yılında İstinye tersanesinin hizmete girmesini kabul edebiliriz. Uzun yıllar Türk ve dünya denizciliğine hizmet etmiş olan tersane 1991 yılında kapatılmıştır. Ayrıca Türkay Kibrit, Kavel Kablo, Termo Teknik, Termo Makina, Beldesan, Beldeyama Fabrikaları yıllarca İstinye’de hizmet vermiştir.
Konumu dolayısı ile İstanbul Boğazı’nın önemli semtlerinden biri olan İstinye günümüzde pek çok önemli işletmeye ev sahipliği yapmaya devam etmektedir.